Для решения задач ВМФ и в интересах задач ПВО страны в середине 60-х годов на космодроме начались испытания спутников «ИС» (истребитель спутников, предназначался для поражения вражеских спутников осколочно-фугасной частью) и «УС» (управляемый спутник, для ведения радиотехнической и радиолокационной разведки в интересах ВМФ СССР). Руководителем по выполнению этой программы был назначен Главный конструктор НПО «Алмаз» член-корреспондент АН СССР Савин Анатолий Иванович. Непосредственное руководство от КБ на технической и стартовой позициях осуществлял Зотов Г.Ф. 

  Для запуска космических аппаратов разведки «ИС» и «УС» использовались космические ракеты-носители 11К67 и 11К69 ОКБ Янгеля М.К.. Помощником Главного конструктора и ведущим по испытаниям РН на полигоне от ОКБ являлся Леонид Данилович Кучма. Главным конструктором автоматизированного наземного стартового комплекса 11П869Э был Всеволод Николаевич Соловьв, а техническим руководителем по отработке наземного оборудования Сиянин И.И.

 Первоначально планировалось, что для запусков спутников «ИС» и «УС» будет использоваться ракета КБ Челомея В.Н. УР-200, однако, данный проект был закрыт, и разработать космический носитель поручили КБ Янгеля М.К. на базе ракеты Р-36 орб. Новая акетаноситель получила название «Циклон».

В состав экспериментального комплекса входили: ракета-носитель «Циклон», техническая позиция и стартовый комплекс в составе двух пусковых установок на площадке № 90. Головным разработчиком комплекса было определено КБ «Южное» М.К. Янгеля, изготовителем - ПО «Южный машиностроительный завод» г. Днепропетровск.

 Головным разработчиком наземного автоматизированного стартового комплекса и технической позиции стало КБ транспортного машиностроения (г. Москва), руководитель В.Н. Соловьв. Для проведения испытаний РН и КА на космодроме было создано Пятое научноиспытательное управление. Начальником управления был назначен полковник Батурин Птр Сергеевич, начальником политотдела – Шитов Н.В., заместителями по испытаниям: по морской тематике Модин В.М., по тематике ПВО Алексеев И.К. Начальниками испытательных отделов были Беличенко Н.Е., Погодин И.И., Янченко М.М., Купчиков К.Ф., Капитонов. Для отработки комплекса была сформирована отдельная нженерно- испытательная часть 46180, командиром которой был назначен подполковник Мансуров Валентин Сергеевич.
 

 Подготовка к испытаниям комплекса «Циклон» началась в 1965 году с переоборудования наземного комплекса ракеты УР-200. Поскольку сроки создания ракеты-носителя были очень сжатыми, М.К. Янгель предложил для первых запусков КА «ИС» и «УС» использовать модернизированные боевые МБР Р-36 и параллельно разрабатывать космический вариант ракеты на базе МБР Р-36 орбитальный.
К 1967 г. весь объм доработок по ракете Р-36 (8К67) и стартовому комплексу был завершен и создан комплекс РН 11К67, который
использовался на промежуточном этапе до 1969 г. для запусков экспериментальных образцов КА. Стартовая масса этой двухступенчатой ракеты (без учета массы космического аппарата) составляет 178,6 тонны. Ракета «Циклон» обеспечивает вывод на круговые орбиты высотой 200 км и наклонением 65° и 90° космических аппаратов мас¬сой 3,2 и 2,7 тонны соответственно.

Первый пуск РН состоялся 27.10.1967 г. с макетом перехватчика ИС («Космос-185»). В течение 2-х лет проведено восемь пусков первого варианта ракеты-носителя «Циклон».